就纯系统建设而言，水上光伏系统主要分为水上打桩式、水上浮台式。
一、水上打桩式的光伏系统因为主要是基础施工难度大些，所以成本也会一定程度上有所增加。（比如抽水，然后往下打桩、再固定支架）
二、漂浮式水上光伏的优劣势如下：
1、主要存在以下优势：
①节约用地：建立在水面上，不占用土地资源，可减少征地费用。
②提高发电量：水体对光伏组件有冷却效应，可以抑制组件表面温度上升，从而获得更高的发电量。根据日本兵库县大型水上光伏电站实验对比分析，由于水面的冷却效果，电池板发电量增加约14％。
③减少蒸发和藻类繁殖：将太阳能电池板覆盖在水面上，理论上可减少水面蒸发量，抑制水中藻类繁殖，有利于水资源的保护。
④运营维护方便：光伏电站建立在水中，可以减少灰尘对组件的污染，且方便组件清洗，同时闲杂人员与动物难以接近组件，可有效防止人员及动物对组件的破坏。
⑤旅游效益：辽阔的水面上整齐排列的光伏组件，可以作为一项具有特色的景点，成为该区域的一道景观，带来旅游效益。
⑥避免组件遮光：对比陆地，水面相对开阔，可以有效避免山体、树林等对组件的遮挡，太阳能照射面积均匀且光照时间长。
⑦降低跟踪系统成本：组件角度、间距一致，方便太阳能跟踪系统的安装和运行，不需要对每块电池板安装双轴跟踪系统，大大减少跟踪系统成本。
⑧节约成本：不需要组件基础和支架，节省基础和支架造价，节约成本。
⑨消纳方便：建于距离村庄、城市较近的水域，可以就近消纳，减少并网难、限电等不利因素，提高效率。
2、存在一些劣势：
①漂浮设备要求高：漂浮式水上光伏需要漂浮设备支撑光伏电池板，浮体架台对抗腐蚀性能、低密度、抗冻胀、抗风浪、寿命、承载能力等均要求较高。
②选址要求高：漂浮式水上光伏电场场址宜选在面积较广、径流稳定、风速低、光照条件好、水位变化较小、开发条件较好、无大规模航运、生态非敏感区等水域。
③不确定因素多：大风、水位、结冰等因素对其影响较大，同时需监测光伏组件对水质、水中鱼类、植物等有无不利影响。
④施工难度大：施工过程需考虑较多因素，水上作业很难大量使用重型机械等进行高效率施工，工序相对要求更多，工期也相应增长。需要潜水或在船上的作业很多。船上作业要考虑平衡性和安全性，也不能损坏水池堤坝等设施。
